В структуре ФТС создано Главное управление таможенного контроля после выпуска товаров во главе с генерал-майором таможенной службы Валерием Селезнёвым. К функциям новой службы относятся таможенные проверки после выпуска товаров, методология и практика применения таможенного законодательства при таможенном контроле после выпуска товаров, взаимодействие с налоговыми органами, региональное курирования и контроль, мониторинг и анализ.